В соответствии с п. 3, ст. 2 ГК РФ "К имущественным отношениям, которые основаны на административном или ином властном подчинении одной стороны другой, в том числе к налоговым и другим финансовым и административным отношениям, гражданское законодательство не применяется, если иное не предусмотрено законодательством." Другими словами в отношениях между юридическим лицом, индивидуальным предпринимателем с органами государственной власти (при этом если отношения основаны на административном или ином властном подчинении) положения ГК РФ не применяются. Т.о. нельзя использовать факсимильную подпись подписывая налоговую декларацию или иной документ подающийся в органы государственной власти. При этом использование факсимиле возможно в отношениях между физическими и юридическими лицами. Но также имейте ввиду, что в договорных отношениях использование факсимильной подписи будет иметь юридическую силу равную собственноручной подписи лишь при предварительном письменной согласии сторон.